「プロ野球ドラフト会議」（２２日、グランドプリンスホテル新高輪）

　阪神、ヤクルトの２球団が高山俊外野手（明大）を１位指名。くじ引き役として阪神・金本監督、ヤクルト・真中監督が壇上へ上がり、真中監督が当たりのガッツポーズを決めたのだが…。その後、当たりくじの確認ミスがあったことが発覚。結局は阪神が交渉権を獲得した。

　同じようなミスは、２００５年のドラフトでも起きていた。

　この年から大学生・社会人ドラフトとの「分離開催」。１０月３日の高校生ドラフトは１巡目指名が重複すれば抽選方式。その抽選結果が誤って発表され、後から交渉権獲得球団が訂正される、ドラフト史上初のトラブルが発生した。

　まず、巨人とオリックスが辻内崇伸投手（大阪桐蔭）を入札し、抽選となったが、オリックスＧＭの中村勝広氏が当たりクジと勘違い。その後、同じく１巡目で日本ハムとソフトバンクがともに陽仲寿内野手（福岡第一、現岱鋼）を入札し抽選が行われたが、ソフトバンク・王監督が中村ＧＭ同様に外れクジを当たりと勘違いした。

　巨人、日本ハムが主催者側に抗議したことで問題が発覚し、辻内の交渉権は巨人、陽の交渉権は日本ハムが獲得したと訂正された。